Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRF1P14222 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRF1P14222 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRF1P14222 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRF1P14222 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRF1P14222 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRF1P14222 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PRF1P14222 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PRF1P14222 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PRF1P14222 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PRF1P14222 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PRF1P14222 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PRF1P14222 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PRF1P14222 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PRF1P14222 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PRF1P14222 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRF1P14222 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRF1P14222 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRF1P14222 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRF1P14222 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRF1P14222 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRF1P14222 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRF1P14222 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRF1P14222 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRF1P14222 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRF1P14222 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRF1P14222 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRF1P14222 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRF1P14222 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRF1P14222 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PRF1P14222 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRF1P14222 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRF1P14222 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRF1P14222 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRF1P14222 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRF1P14222 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRF1P14222 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRF1P14222 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PRF1P14222 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRF1P14222 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRF1P14222 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRF1P14222 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRF1P14222 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRF1P14222 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRF1P14222 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRF1P14222 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PRF1P14222 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRF1P14222 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRF1P14222 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PRF1P14222 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRF1P14222 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRF1P14222 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRF1P14222 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PRF1P14222 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PRF1P14222 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRF1P14222 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PRF1P14222 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PRF1P14222 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PRF1P14222 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PRF1P14222 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRF1P14222 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PRF1P14222 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRF1P14222 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRF1P14222 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRF1P14222 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRF1P14222 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRF1P14222 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRF1P14222 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRF1P14222 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PRF1P14222 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRF1P14222 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRF1P14222 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRF1P14222 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRF1P14222 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRF1P14222 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRF1P14222 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRF1P14222 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRF1P14222 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRF1P14222 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRF1P14222 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRF1P14222 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRF1P14222 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRF1P14222 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRF1P14222 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRF1P14222 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRF1P14222 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRF1P14222 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PRF1P14222 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PRF1P14222 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PRF1P14222 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRF1P14222 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRF1P14222 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PRF1P14222 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRF1P14222 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRF1P14222 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRF1P14222 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PRF1P14222 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PRF1P14222 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRF1P14222 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRF1P14222 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms