Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNNT1P13805 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNNT1P13805 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNNT1P13805 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNNT1P13805 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNNT1P13805 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNNT1P13805 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNNT1P13805 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNNT1P13805 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNNT1P13805 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNNT1P13805 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNNT1P13805 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNNT1P13805 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNNT1P13805 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNNT1P13805 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNNT1P13805 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNNT1P13805 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNNT1P13805 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNNT1P13805 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNNT1P13805 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNNT1P13805 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TNNT1P13805 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNNT1P13805 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNNT1P13805 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNNT1P13805 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNNT1P13805 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TNNT1P13805 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNNT1P13805 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNNT1P13805 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNNT1P13805 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNNT1P13805 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNNT1P13805 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNNT1P13805 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNNT1P13805 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNNT1P13805 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNNT1P13805 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNNT1P13805 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNNT1P13805 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNNT1P13805 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNNT1P13805 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNNT1P13805 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNNT1P13805 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNNT1P13805 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNNT1P13805 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNNT1P13805 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNNT1P13805 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNNT1P13805 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNNT1P13805 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNNT1P13805 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNNT1P13805 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNNT1P13805 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TNNT1P13805 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TNNT1P13805 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TNNT1P13805 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TNNT1P13805 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TNNT1P13805 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TNNT1P13805 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TNNT1P13805 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TNNT1P13805 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TNNT1P13805 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TNNT1P13805 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNNT1P13805 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNNT1P13805 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNNT1P13805 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNNT1P13805 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNNT1P13805 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNNT1P13805 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNNT1P13805 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNNT1P13805 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNNT1P13805 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNNT1P13805 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNNT1P13805 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNNT1P13805 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNNT1P13805 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNNT1P13805 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNNT1P13805 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TNNT1P13805 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNNT1P13805 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNNT1P13805 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNNT1P13805 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNNT1P13805 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNNT1P13805 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNNT1P13805 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNNT1P13805 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNNT1P13805 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNNT1P13805 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNNT1P13805 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNNT1P13805 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNNT1P13805 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNNT1P13805 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNNT1P13805 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TNNT1P13805 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNNT1P13805 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNNT1P13805 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNNT1P13805 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNNT1P13805 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNNT1P13805 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNNT1P13805 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNNT1P13805 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TNNT1P13805 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms