Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ITGA4P13612 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms