Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
GP1BBP13224 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GP1BBP13224 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms