Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BMP3P12645 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BMP3P12645 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BMP3P12645 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BMP3P12645 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BMP3P12645 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BMP3P12645 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BMP3P12645 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BMP3P12645 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BMP3P12645 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BMP3P12645 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BMP3P12645 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BMP3P12645 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BMP3P12645 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BMP3P12645 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BMP3P12645 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BMP3P12645 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BMP3P12645 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BMP3P12645 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BMP3P12645 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BMP3P12645 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BMP3P12645 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BMP3P12645 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BMP3P12645 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BMP3P12645 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BMP3P12645 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BMP3P12645 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BMP3P12645 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BMP3P12645 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BMP3P12645 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BMP3P12645 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BMP3P12645 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BMP3P12645 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BMP3P12645 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BMP3P12645 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BMP3P12645 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BMP3P12645 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BMP3P12645 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BMP3P12645 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BMP3P12645 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BMP3P12645 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BMP3P12645 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BMP3P12645 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
BMP3P12645 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BMP3P12645 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BMP3P12645 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
BMP3P12645 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BMP3P12645 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BMP3P12645 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BMP3P12645 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BMP3P12645 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BMP3P12645 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BMP3P12645 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BMP3P12645 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BMP3P12645 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BMP3P12645 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BMP3P12645 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BMP3P12645 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BMP3P12645 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BMP3P12645 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BMP3P12645 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BMP3P12645 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BMP3P12645 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
BMP3P12645 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BMP3P12645 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BMP3P12645 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BMP3P12645 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BMP3P12645 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
BMP3P12645 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
BMP3P12645 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BMP3P12645 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BMP3P12645 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BMP3P12645 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BMP3P12645 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BMP3P12645 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BMP3P12645 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BMP3P12645 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BMP3P12645 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BMP3P12645 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BMP3P12645 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BMP3P12645 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BMP3P12645 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BMP3P12645 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BMP3P12645 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BMP3P12645 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BMP3P12645 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BMP3P12645 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BMP3P12645 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BMP3P12645 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BMP3P12645 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BMP3P12645 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BMP3P12645 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BMP3P12645 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BMP3P12645 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BMP3P12645 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BMP3P12645 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BMP3P12645 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BMP3P12645 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BMP3P12645 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BMP3P12645 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms