Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
TOP2AP11388 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TOP2AP11388 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms