Protein–RNA interactions for Protein: P0DP01

IGHV1-8, Immunoglobulin heavy variable 1-8, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV1-8P0DP01 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV1-8P0DP01 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms