Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM200BP0CF97 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM200BP0CF97 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM200BP0CF97 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM200BP0CF97 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM200BP0CF97 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM200BP0CF97 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM200BP0CF97 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM200BP0CF97 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM200BP0CF97 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM200BP0CF97 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM200BP0CF97 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM200BP0CF97 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FAM200BP0CF97 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM200BP0CF97 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM200BP0CF97 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM200BP0CF97 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM200BP0CF97 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM200BP0CF97 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM200BP0CF97 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
FAM200BP0CF97 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM200BP0CF97 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM200BP0CF97 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM200BP0CF97 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM200BP0CF97 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM200BP0CF97 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM200BP0CF97 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM200BP0CF97 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM200BP0CF97 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM200BP0CF97 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM200BP0CF97 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM200BP0CF97 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM200BP0CF97 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM200BP0CF97 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM200BP0CF97 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM200BP0CF97 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM200BP0CF97 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM200BP0CF97 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM200BP0CF97 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM200BP0CF97 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM200BP0CF97 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM200BP0CF97 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM200BP0CF97 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FAM200BP0CF97 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM200BP0CF97 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM200BP0CF97 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM200BP0CF97 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM200BP0CF97 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM200BP0CF97 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM200BP0CF97 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM200BP0CF97 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM200BP0CF97 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM200BP0CF97 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
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FAM200BP0CF97 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM200BP0CF97 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
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FAM200BP0CF97 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM200BP0CF97 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM200BP0CF97 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM200BP0CF97 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM200BP0CF97 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM200BP0CF97 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM200BP0CF97 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FAM200BP0CF97 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FAM200BP0CF97 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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FAM200BP0CF97 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM200BP0CF97 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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FAM200BP0CF97 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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FAM200BP0CF97 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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FAM200BP0CF97 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM200BP0CF97 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM200BP0CF97 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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FAM200BP0CF97 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM200BP0CF97 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM200BP0CF97 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM200BP0CF97 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM200BP0CF97 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FAM200BP0CF97 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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FAM200BP0CF97 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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FAM200BP0CF97 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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