Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC172P0C7W6 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC172P0C7W6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms