Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC175P0C221 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms