Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VIL1P09327 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VIL1P09327 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VIL1P09327 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VIL1P09327 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VIL1P09327 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VIL1P09327 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VIL1P09327 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VIL1P09327 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VIL1P09327 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VIL1P09327 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VIL1P09327 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VIL1P09327 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VIL1P09327 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VIL1P09327 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VIL1P09327 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VIL1P09327 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VIL1P09327 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VIL1P09327 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VIL1P09327 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VIL1P09327 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VIL1P09327 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VIL1P09327 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VIL1P09327 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VIL1P09327 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VIL1P09327 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VIL1P09327 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VIL1P09327 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VIL1P09327 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VIL1P09327 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VIL1P09327 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VIL1P09327 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VIL1P09327 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VIL1P09327 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VIL1P09327 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VIL1P09327 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
VIL1P09327 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VIL1P09327 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VIL1P09327 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VIL1P09327 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VIL1P09327 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
VIL1P09327 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VIL1P09327 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VIL1P09327 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
VIL1P09327 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
VIL1P09327 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VIL1P09327 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VIL1P09327 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VIL1P09327 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VIL1P09327 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
VIL1P09327 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VIL1P09327 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VIL1P09327 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VIL1P09327 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VIL1P09327 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VIL1P09327 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VIL1P09327 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VIL1P09327 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VIL1P09327 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VIL1P09327 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VIL1P09327 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VIL1P09327 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VIL1P09327 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VIL1P09327 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VIL1P09327 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VIL1P09327 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VIL1P09327 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VIL1P09327 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VIL1P09327 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VIL1P09327 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VIL1P09327 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VIL1P09327 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VIL1P09327 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VIL1P09327 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VIL1P09327 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VIL1P09327 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VIL1P09327 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VIL1P09327 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VIL1P09327 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VIL1P09327 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VIL1P09327 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VIL1P09327 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VIL1P09327 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VIL1P09327 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VIL1P09327 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VIL1P09327 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VIL1P09327 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VIL1P09327 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VIL1P09327 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VIL1P09327 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VIL1P09327 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VIL1P09327 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VIL1P09327 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
VIL1P09327 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VIL1P09327 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
VIL1P09327 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VIL1P09327 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VIL1P09327 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VIL1P09327 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VIL1P09327 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms