Protein–RNA interactions for Protein: P04818

TYMS, Thymidylate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TYMSP04818 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TYMSP04818 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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