Protein–RNA interactions for Protein: P01893

HLA-H, Putative HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain H, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-HP01893 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-HP01893 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-HP01893 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-HP01893 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-HP01893 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-HP01893 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-HP01893 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-HP01893 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-HP01893 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-HP01893 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-HP01893 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-HP01893 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-HP01893 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
HLA-HP01893 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-HP01893 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms