Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYF2O95926 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYF2O95926 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYF2O95926 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYF2O95926 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYF2O95926 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYF2O95926 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYF2O95926 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYF2O95926 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYF2O95926 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYF2O95926 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYF2O95926 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYF2O95926 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SYF2O95926 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYF2O95926 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYF2O95926 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SYF2O95926 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYF2O95926 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYF2O95926 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYF2O95926 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYF2O95926 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SYF2O95926 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYF2O95926 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYF2O95926 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYF2O95926 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYF2O95926 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYF2O95926 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYF2O95926 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYF2O95926 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYF2O95926 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYF2O95926 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYF2O95926 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYF2O95926 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYF2O95926 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYF2O95926 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYF2O95926 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYF2O95926 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYF2O95926 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYF2O95926 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYF2O95926 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYF2O95926 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYF2O95926 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYF2O95926 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYF2O95926 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYF2O95926 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYF2O95926 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYF2O95926 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYF2O95926 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYF2O95926 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYF2O95926 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYF2O95926 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYF2O95926 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYF2O95926 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYF2O95926 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYF2O95926 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYF2O95926 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYF2O95926 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYF2O95926 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYF2O95926 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYF2O95926 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYF2O95926 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYF2O95926 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYF2O95926 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYF2O95926 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SYF2O95926 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SYF2O95926 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SYF2O95926 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SYF2O95926 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SYF2O95926 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SYF2O95926 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SYF2O95926 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
SYF2O95926 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SYF2O95926 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYF2O95926 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYF2O95926 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYF2O95926 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SYF2O95926 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYF2O95926 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SYF2O95926 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYF2O95926 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYF2O95926 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYF2O95926 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYF2O95926 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYF2O95926 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYF2O95926 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYF2O95926 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYF2O95926 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYF2O95926 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYF2O95926 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYF2O95926 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYF2O95926 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYF2O95926 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SYF2O95926 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYF2O95926 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYF2O95926 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYF2O95926 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYF2O95926 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYF2O95926 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYF2O95926 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYF2O95926 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms