Protein–RNA interactions for Protein: O95696

BRD1, Bromodomain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD1O95696 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRD1O95696 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRD1O95696 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRD1O95696 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRD1O95696 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRD1O95696 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRD1O95696 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRD1O95696 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRD1O95696 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRD1O95696 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BRD1O95696 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRD1O95696 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRD1O95696 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRD1O95696 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRD1O95696 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRD1O95696 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRD1O95696 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRD1O95696 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRD1O95696 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRD1O95696 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRD1O95696 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRD1O95696 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRD1O95696 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRD1O95696 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRD1O95696 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRD1O95696 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRD1O95696 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRD1O95696 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRD1O95696 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRD1O95696 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRD1O95696 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRD1O95696 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRD1O95696 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRD1O95696 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRD1O95696 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRD1O95696 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRD1O95696 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRD1O95696 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRD1O95696 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRD1O95696 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRD1O95696 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRD1O95696 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRD1O95696 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRD1O95696 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRD1O95696 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRD1O95696 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRD1O95696 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BRD1O95696 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRD1O95696 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRD1O95696 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRD1O95696 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRD1O95696 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRD1O95696 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRD1O95696 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRD1O95696 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRD1O95696 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRD1O95696 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRD1O95696 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRD1O95696 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRD1O95696 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRD1O95696 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRD1O95696 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRD1O95696 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRD1O95696 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRD1O95696 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRD1O95696 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRD1O95696 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRD1O95696 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRD1O95696 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRD1O95696 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRD1O95696 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRD1O95696 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRD1O95696 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRD1O95696 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRD1O95696 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRD1O95696 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRD1O95696 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRD1O95696 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRD1O95696 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRD1O95696 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRD1O95696 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRD1O95696 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BRD1O95696 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRD1O95696 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRD1O95696 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRD1O95696 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRD1O95696 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRD1O95696 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRD1O95696 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRD1O95696 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRD1O95696 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BRD1O95696 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRD1O95696 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BRD1O95696 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRD1O95696 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BRD1O95696 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRD1O95696 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRD1O95696 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRD1O95696 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRD1O95696 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms