Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNKO75909 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNKO75909 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNKO75909 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNKO75909 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNKO75909 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNKO75909 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNKO75909 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNKO75909 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNKO75909 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNKO75909 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNKO75909 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCNKO75909 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNKO75909 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNKO75909 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNKO75909 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNKO75909 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNKO75909 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNKO75909 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNKO75909 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNKO75909 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNKO75909 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNKO75909 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNKO75909 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNKO75909 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNKO75909 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNKO75909 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNKO75909 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNKO75909 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNKO75909 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNKO75909 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNKO75909 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNKO75909 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNKO75909 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNKO75909 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNKO75909 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNKO75909 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNKO75909 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNKO75909 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNKO75909 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNKO75909 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNKO75909 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNKO75909 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCNKO75909 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNKO75909 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNKO75909 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNKO75909 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNKO75909 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNKO75909 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNKO75909 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNKO75909 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNKO75909 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNKO75909 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNKO75909 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNKO75909 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNKO75909 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNKO75909 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNKO75909 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNKO75909 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNKO75909 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNKO75909 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNKO75909 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNKO75909 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNKO75909 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNKO75909 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNKO75909 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNKO75909 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNKO75909 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNKO75909 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNKO75909 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCNKO75909 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNKO75909 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNKO75909 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNKO75909 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNKO75909 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNKO75909 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNKO75909 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNKO75909 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNKO75909 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNKO75909 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNKO75909 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNKO75909 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNKO75909 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNKO75909 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNKO75909 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNKO75909 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNKO75909 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNKO75909 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNKO75909 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNKO75909 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNKO75909 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNKO75909 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNKO75909 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNKO75909 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNKO75909 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNKO75909 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNKO75909 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNKO75909 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNKO75909 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCNKO75909 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms