Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPFIA3O75145 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIA3O75145 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms