Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIN3BO60391 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GRIN3BO60391 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GRIN3BO60391 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GRIN3BO60391 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GRIN3BO60391 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIN3BO60391 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIN3BO60391 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIN3BO60391 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIN3BO60391 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIN3BO60391 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIN3BO60391 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIN3BO60391 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIN3BO60391 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIN3BO60391 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIN3BO60391 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIN3BO60391 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIN3BO60391 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIN3BO60391 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIN3BO60391 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIN3BO60391 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIN3BO60391 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIN3BO60391 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIN3BO60391 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIN3BO60391 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIN3BO60391 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIN3BO60391 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIN3BO60391 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIN3BO60391 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIN3BO60391 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIN3BO60391 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIN3BO60391 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIN3BO60391 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIN3BO60391 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIN3BO60391 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIN3BO60391 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIN3BO60391 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIN3BO60391 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIN3BO60391 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIN3BO60391 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIN3BO60391 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIN3BO60391 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIN3BO60391 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIN3BO60391 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIN3BO60391 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIN3BO60391 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIN3BO60391 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIN3BO60391 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIN3BO60391 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIN3BO60391 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIN3BO60391 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIN3BO60391 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIN3BO60391 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIN3BO60391 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms