Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMARCA5O60264 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMARCA5O60264 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms