Protein–RNA interactions for Protein: O60248

SOX15, Protein SOX-15, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX15O60248 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SOX15O60248 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SOX15O60248 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SOX15O60248 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOX15O60248 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOX15O60248 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOX15O60248 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOX15O60248 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOX15O60248 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOX15O60248 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOX15O60248 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOX15O60248 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOX15O60248 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOX15O60248 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOX15O60248 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOX15O60248 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOX15O60248 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOX15O60248 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SOX15O60248 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOX15O60248 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOX15O60248 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOX15O60248 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SOX15O60248 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOX15O60248 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOX15O60248 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOX15O60248 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOX15O60248 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOX15O60248 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOX15O60248 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOX15O60248 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOX15O60248 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOX15O60248 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOX15O60248 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOX15O60248 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOX15O60248 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOX15O60248 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOX15O60248 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOX15O60248 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOX15O60248 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOX15O60248 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOX15O60248 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SOX15O60248 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX15O60248 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX15O60248 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX15O60248 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX15O60248 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX15O60248 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX15O60248 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX15O60248 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX15O60248 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX15O60248 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX15O60248 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX15O60248 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX15O60248 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX15O60248 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX15O60248 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX15O60248 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX15O60248 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX15O60248 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX15O60248 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX15O60248 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX15O60248 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX15O60248 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX15O60248 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX15O60248 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX15O60248 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX15O60248 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX15O60248 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX15O60248 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX15O60248 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX15O60248 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX15O60248 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX15O60248 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX15O60248 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX15O60248 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX15O60248 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX15O60248 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX15O60248 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX15O60248 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SOX15O60248 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX15O60248 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX15O60248 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX15O60248 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX15O60248 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX15O60248 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX15O60248 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX15O60248 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX15O60248 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX15O60248 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX15O60248 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX15O60248 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX15O60248 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX15O60248 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX15O60248 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX15O60248 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX15O60248 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX15O60248 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX15O60248 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX15O60248 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOX15O60248 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms