Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SRGAP3O43295 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms