Protein–RNA interactions for Protein: O15541

RNF113A, RING finger protein 113A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF113AO15541 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RNF113AO15541 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF113AO15541 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms