Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLOCKO15516 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CLOCKO15516 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms