Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR1CO15160 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POLR1CO15160 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms