Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC27A2O14975 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC27A2O14975 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms