Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
POLRMTO00411 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POLRMTO00411 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms