Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NEDD8-MDP1E9PL57 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NEDD8-MDP1E9PL57 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms