Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
GOLGA6L9A6NEM1 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms