Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PALM3A6NDB9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms