Protein–RNA interactions for Protein: A6NDA9

LRIT2, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT2A6NDA9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRIT2A6NDA9 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms