Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VWA3AA6NCI4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms