Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6S5

IGKV1-27, Immunoglobulin kappa variable 1-27, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-27A0A075B6S5 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV1-27A0A075B6S5 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms