Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ87

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQ87 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
U3KQ87 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
U3KQ87 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
U3KQ87 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
U3KQ87 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
U3KQ87 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
U3KQ87 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
U3KQ87 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
U3KQ87 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
U3KQ87 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
U3KQ87 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
U3KQ87 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
U3KQ87 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
U3KQ87 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
U3KQ87 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
U3KQ87 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
U3KQ87 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
U3KQ87 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
U3KQ87 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
U3KQ87 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
U3KQ87 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
U3KQ87 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
U3KQ87 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
U3KQ87 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
U3KQ87 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
U3KQ87 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
U3KQ87 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
U3KQ87 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
U3KQ87 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
U3KQ87 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
U3KQ87 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
U3KQ87 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
U3KQ87 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
U3KQ87 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
U3KQ87 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
U3KQ87 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
U3KQ87 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
U3KQ87 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
U3KQ87 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
U3KQ87 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
U3KQ87 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
U3KQ87 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
U3KQ87 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
U3KQ87 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
U3KQ87 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
U3KQ87 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
U3KQ87 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
U3KQ87 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
U3KQ87 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
U3KQ87 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
U3KQ87 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
U3KQ87 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
U3KQ87 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
U3KQ87 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
U3KQ87 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
U3KQ87 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
U3KQ87 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
U3KQ87 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
U3KQ87 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
U3KQ87 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
U3KQ87 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
U3KQ87 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
U3KQ87 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
U3KQ87 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
U3KQ87 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
U3KQ87 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
U3KQ87 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
U3KQ87 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
U3KQ87 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
U3KQ87 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
U3KQ87 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
U3KQ87 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
U3KQ87 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
U3KQ87 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
U3KQ87 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
U3KQ87 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
U3KQ87 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
U3KQ87 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
U3KQ87 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
U3KQ87 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
U3KQ87 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
U3KQ87 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
U3KQ87 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
U3KQ87 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
U3KQ87 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
U3KQ87 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
U3KQ87 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
U3KQ87 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
U3KQ87 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
U3KQ87 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
U3KQ87 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
U3KQ87 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
U3KQ87 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
U3KQ87 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
U3KQ87 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
U3KQ87 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
U3KQ87 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
U3KQ87 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
U3KQ87 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
U3KQ87 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms