Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP16Q9Y5T5 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms