Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHBDD3Q9Y3P4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms