Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A4

RRP7A, Ribosomal RNA-processing protein 7 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7AQ9Y3A4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRP7AQ9Y3A4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRP7AQ9Y3A4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RRP7AQ9Y3A4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRP7AQ9Y3A4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP7AQ9Y3A4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP7AQ9Y3A4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP7AQ9Y3A4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP7AQ9Y3A4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP7AQ9Y3A4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP7AQ9Y3A4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP7AQ9Y3A4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP7AQ9Y3A4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP7AQ9Y3A4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP7AQ9Y3A4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP7AQ9Y3A4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP7AQ9Y3A4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP7AQ9Y3A4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP7AQ9Y3A4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP7AQ9Y3A4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP7AQ9Y3A4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP7AQ9Y3A4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP7AQ9Y3A4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP7AQ9Y3A4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP7AQ9Y3A4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP7AQ9Y3A4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP7AQ9Y3A4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP7AQ9Y3A4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP7AQ9Y3A4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP7AQ9Y3A4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP7AQ9Y3A4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP7AQ9Y3A4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP7AQ9Y3A4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP7AQ9Y3A4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP7AQ9Y3A4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP7AQ9Y3A4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP7AQ9Y3A4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP7AQ9Y3A4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP7AQ9Y3A4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP7AQ9Y3A4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP7AQ9Y3A4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRP7AQ9Y3A4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRP7AQ9Y3A4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRP7AQ9Y3A4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RRP7AQ9Y3A4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRP7AQ9Y3A4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRP7AQ9Y3A4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRP7AQ9Y3A4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RRP7AQ9Y3A4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRP7AQ9Y3A4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRP7AQ9Y3A4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRP7AQ9Y3A4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RRP7AQ9Y3A4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRP7AQ9Y3A4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRP7AQ9Y3A4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRP7AQ9Y3A4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RRP7AQ9Y3A4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
RRP7AQ9Y3A4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RRP7AQ9Y3A4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RRP7AQ9Y3A4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRP7AQ9Y3A4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRP7AQ9Y3A4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRP7AQ9Y3A4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRP7AQ9Y3A4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RRP7AQ9Y3A4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RRP7AQ9Y3A4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRP7AQ9Y3A4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRP7AQ9Y3A4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP7AQ9Y3A4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP7AQ9Y3A4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP7AQ9Y3A4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP7AQ9Y3A4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP7AQ9Y3A4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP7AQ9Y3A4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP7AQ9Y3A4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP7AQ9Y3A4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP7AQ9Y3A4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP7AQ9Y3A4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP7AQ9Y3A4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP7AQ9Y3A4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP7AQ9Y3A4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP7AQ9Y3A4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP7AQ9Y3A4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP7AQ9Y3A4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP7AQ9Y3A4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP7AQ9Y3A4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP7AQ9Y3A4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP7AQ9Y3A4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRP7AQ9Y3A4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRP7AQ9Y3A4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRP7AQ9Y3A4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRP7AQ9Y3A4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRP7AQ9Y3A4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RRP7AQ9Y3A4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRP7AQ9Y3A4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRP7AQ9Y3A4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRP7AQ9Y3A4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRP7AQ9Y3A4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRP7AQ9Y3A4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRP7AQ9Y3A4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms