Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I6

NINL, Ninein-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINLQ9Y2I6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NINLQ9Y2I6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms