Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DTX4Q9Y2E6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DTX4Q9Y2E6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms