Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRAPPC4Q9Y296 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms