Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HDAC5Q9UQL6 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC5Q9UQL6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms