Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHF8Q9UPP1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms