Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
USP18Q9UMW8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP18Q9UMW8 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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