Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM44

HHLA2, HERV-H LTR-associating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA2Q9UM44 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HHLA2Q9UM44 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HHLA2Q9UM44 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HHLA2Q9UM44 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HHLA2Q9UM44 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HHLA2Q9UM44 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HHLA2Q9UM44 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HHLA2Q9UM44 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HHLA2Q9UM44 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HHLA2Q9UM44 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HHLA2Q9UM44 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HHLA2Q9UM44 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HHLA2Q9UM44 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HHLA2Q9UM44 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HHLA2Q9UM44 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HHLA2Q9UM44 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HHLA2Q9UM44 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HHLA2Q9UM44 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HHLA2Q9UM44 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HHLA2Q9UM44 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HHLA2Q9UM44 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HHLA2Q9UM44 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HHLA2Q9UM44 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HHLA2Q9UM44 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HHLA2Q9UM44 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HHLA2Q9UM44 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HHLA2Q9UM44 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HHLA2Q9UM44 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HHLA2Q9UM44 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HHLA2Q9UM44 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HHLA2Q9UM44 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HHLA2Q9UM44 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HHLA2Q9UM44 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HHLA2Q9UM44 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HHLA2Q9UM44 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HHLA2Q9UM44 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HHLA2Q9UM44 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HHLA2Q9UM44 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HHLA2Q9UM44 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HHLA2Q9UM44 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HHLA2Q9UM44 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HHLA2Q9UM44 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HHLA2Q9UM44 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HHLA2Q9UM44 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HHLA2Q9UM44 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HHLA2Q9UM44 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HHLA2Q9UM44 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HHLA2Q9UM44 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HHLA2Q9UM44 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HHLA2Q9UM44 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HHLA2Q9UM44 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HHLA2Q9UM44 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HHLA2Q9UM44 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HHLA2Q9UM44 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HHLA2Q9UM44 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HHLA2Q9UM44 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HHLA2Q9UM44 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HHLA2Q9UM44 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HHLA2Q9UM44 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HHLA2Q9UM44 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HHLA2Q9UM44 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HHLA2Q9UM44 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HHLA2Q9UM44 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HHLA2Q9UM44 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HHLA2Q9UM44 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HHLA2Q9UM44 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HHLA2Q9UM44 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HHLA2Q9UM44 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HHLA2Q9UM44 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HHLA2Q9UM44 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HHLA2Q9UM44 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HHLA2Q9UM44 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HHLA2Q9UM44 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HHLA2Q9UM44 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA2Q9UM44 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA2Q9UM44 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA2Q9UM44 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA2Q9UM44 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA2Q9UM44 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA2Q9UM44 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA2Q9UM44 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA2Q9UM44 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA2Q9UM44 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA2Q9UM44 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA2Q9UM44 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA2Q9UM44 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA2Q9UM44 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA2Q9UM44 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA2Q9UM44 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA2Q9UM44 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA2Q9UM44 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA2Q9UM44 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA2Q9UM44 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA2Q9UM44 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA2Q9UM44 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA2Q9UM44 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA2Q9UM44 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA2Q9UM44 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA2Q9UM44 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HHLA2Q9UM44 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms