Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SALL4Q9UJQ4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL4Q9UJQ4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms