Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GPN3Q9UHW5 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms