Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
USP25Q9UHP3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP25Q9UHP3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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