Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPASTQ9UBP0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPASTQ9UBP0 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPASTQ9UBP0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPASTQ9UBP0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPASTQ9UBP0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPASTQ9UBP0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPASTQ9UBP0 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPASTQ9UBP0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPASTQ9UBP0 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPASTQ9UBP0 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPASTQ9UBP0 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SPASTQ9UBP0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SPASTQ9UBP0 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SPASTQ9UBP0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPASTQ9UBP0 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SPASTQ9UBP0 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPASTQ9UBP0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms