Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2Q2

FRMD4A, FERM domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,039 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD4AQ9P2Q2 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FRMD4AQ9P2Q2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMD4AQ9P2Q2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms