Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHRF1Q9P1Y6 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHRF1Q9P1Y6 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms