Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZJ4

SACS, Sacsin, humanhuman

Predictions only

Length 4,579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SACSQ9NZJ4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SACSQ9NZJ4 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms